En el 2005, se creó la Unidad de Gestión de Calidad y Auditorías de Procesos –UGC-, como parte de un proyecto apoyado por el Banco Mundial, cuya función específica fue la implantación de un Sistema de Gestión de la Calidad basada en las Normas ISO 9000, con el afán de crear la cultura de calidad que permitiera a los colaboradores brindar un servicio que satisfaga las expectativas de los(las) usuarios(as).

En julio de 2007 el Ministerio de Educación logra la primera certificación de los procesos administrativos en la Planta Central, Dirección General de Educación Física –DIGEF-, Dirección de Recursos Humanos –DIREH- y las Direcciones Departamentales de Educación (DIDEDUC) de Quetzaltenango, Baja Verapaz y Retalhuleu, incluyendo a finales de 2007, a El Progreso y Sacatepéquez

A finales de 2007 se decide que la Gestión de la Calidad se debe institucionalizar y no ser solamente un proyecto, por lo cual la UGC es absorbida por Ministerio de Educación y se crea la Dirección de Desarrollo y Fortalecimiento Institucional –DIDEFI-, por medio del Acuerdo Gubernativo 377-2007.  Las funciones principales de la nueva dependencia fueron ratificadas en el 2008 por el Acuerdo Gubernativo 225-2008, Título I, Capítulo II, Artículo 23 donde se establece que la Dirección de Desarrollo y Fortalecimiento Institucional -DIDEFI-, es la dependencia responsable de asegurar dentro del Ministerio de Educación, una gestión enfocada a procesos, a través del Sistema de Gestión de Calidad e integrar e implementar políticas de modernización.

Las funciones asignadas a esta Dirección son:

1. Actualizar periódicamente el organigrama institucional del Ministerio de Educación.
2. Emitir dictámenes sobre la planificación de recursos humanos administrativos, conforme a los procesos establecidos.
3. Realizar los estudios de cargas de trabajo, descripción y funciones de puestos administrativos, de acuerdo con los procesos establecidos.
4. Elaborar y mantener actualizados manuales de funciones y procedimientos de cada dependencia del Ministerio de Educación.
5. Dar seguimiento al cumplimiento de los procesos establecidos en el Sistema de Gestión de Calidad, mediante el monitoreo de los indicadores correspondientes.
6. Recibir, evaluar, diseñar y darle seguimiento a la implementación de la mejora continua de los procesos del Sistema de Gestión de Calidad.
7. Coordinar la implementación, documentación, mantenimiento y mejoramiento del Sistema de Gestión de Calidad.
8. Participar en la elaboración de la Planificación  Estratégica y el Plan Operativo Anual de la Institución, con el fin de integrar el Plan de Acción de Modernización.
9. Asesorar al Despacho Superior en  materia de programas de modernización, mejoramiento continuo, desconcentración administrativa y sustantiva.